Στο διεθνές αεροδρόμιο της Αθήνας προσγειώθηκε στις 21:56 η πτήση ΕΚ 209 της Emirates, που είχε προορισμό τη Νέα Υόρκη. Είχε προηγηθεί η ειδοποίηση από τις αμερικανικές μυστικές υπηρεσίες για ύπαρξη ύποπτου επιβάτη στην πτήση.
Η ίδια πληροφορία υπήρχε και για έτερη πτήση με προορισμό το Ντουμπάι, η οποία ωστόσο δεν απογειώθηκε.
Η πτήση ΕΚ 209, είχε ήδη απογειωθεί και βρισκόταν πάνω από την Ιταλία (Σαρδηνία), όταν ο πιλότος ειδοποιήθηκε να προσγειωθεί άμεσα. Ωστόσο, ούτε η Γαλλία, ούτε η Ιταλία δέχτηκαν να προσγειωθεί σε κάποιο από τα αεροδρόμιά τους το αεροπλάνο και έτσι αυτό επέστρεψε στην Αθήνα, τόπο εκκίνησης του δρομολογίου.
Μάλιστα, το αεροπλάνο άλλαξε διαδρομή και πήγαινε μόνον πάνω από τη θάλασσα, αποφεύγοντας να πετάξει πάνω από τη στεριά.
Η πτήση ΕΚ 209, με 228 επιβάτες και 18μελές πλήρωμα, από την ώρα που μπήκε στον εθνικό εναέριο χώρο, συνοδευόταν από δύο F16 της Πολεμικής μας Αεροπορίας, που απογειώθηκαν στις 21:09 από τη βάση της Σούδας.
Το αεροπλάνο της Emirates ήταν 120 μίλια νοτιοδυτικά της Καλαμάτας, όταν δόθηκε εντολή απογείωσης στα μαχητικά να απογειωθούν. Την εντολή έδωσε το ΝΑΤΟ.